في إطار إعادة تهيئة وتنشيط ميناء صفاقس التجاري وبعث أنشطة جديدة تتماشى مع المحيط العمراني لمدينة صفاقس وحرصا على اندماج الميناء مع محيطه الخارجي وضمان تعايشه مع مشروع تبرورة تركزت جهود المصالح المختصة بوزارة النقل على دراسة هذا الموضوع لتقديم الحلول المناسبة والتي تراعي الجوانب البيئية والاقتصادية بالجهة وتيسير حركة المرور بمنطقة الميناء وضمان نجاح المشاريع المتمثلة خاصة في تطوير الميناء للاستجابة لنمو الحركة الاقتصادية بالجهة ومواصلة مشروع تبرورة في أحسن الظّروف. وتمثّلت أهمّ الاقتراحات في ما يلي: تهيئة الشواطئ القديمة بمدينة صفاقس واقتطاع شريط بعرض 50م في الميناء لفائدة المدينة. تحويل محطة السكة الحديدية نحو الشمال بحوالي 300 متر لتحقيق التّواصل بين المدينة ومشروع تبرورة عبر شارعي الحبيب بورقيبة وعلي بلهوان وتقريبها من القطب متعدّد الوسائط بالمدينة. اقتطاع شريط بعرض 18 مترا من الأرصفة الشمالية للميناء لتوسعة المدخل الجنوبي لمدينة صفاقس وتسهيل حركة المرور وتخصيص هذه الأرصفة التي تطل مباشرة على المدينة لحركة سفن الرحلات السياحية. إنجاز محطة سكك للبضائع بمنطقة «طينة» ضمن منطقة الخدمات اللوجستية المزمع إنجازها بالمكان. إنجاز رصيف للحاويات بالمنطقة البترولية بالميناء التجاري الذي بلغ طاقته القصوى والأخذ بعين الاعتبار تطوّر حركة الحاويات. تحويل أنشطة نقل البضائع ومنشآت الصيانة من موقعها الحالي بمحطة صفاقس نحو طينة والذي سيشهد أيضا إنجاز منطقة خدمات لوجستية. استغلال محطة صفاقس الحالية للمسافرين فقط وتحويل مبنى لمحطة بما يسمح بتحقيق التواصل مع منطقة تبرورة وبما يتّفق مع موقع القطب متعدّد الأنماط بمشروع تطوير منظومة النقل الجماعي بصفاقس.