قال شيخ جامع الزيتونة حسين العبيدي في تصريح لوكالة "بناء نيوز" اليوم الخميس 01 أوت 2013، إنّه لا ينبغي أن تكون المساجد مسرحا لاقتحام البوليس أو تكون حلبة للصراع السياسي، باعتبار أنّ المساجد جعلت للصلاة والذكر، مضيفا أنّه لا يمكن جعل بيوت الله حلقة من حلقات الصراع بين الأحزاب أو الطوائف، وذلك في ردّ منه على تصريحات الشيخ فريد الباجي التي دعا فيها قوات الأمن إلى اقتحام المساجد والتعامل مع تنظيم أنصار الشريعة على أساس أنّه تنظيم إرهابي. وأوضح الشيخ حسين العبيدي أنّ الشيخ فريد الباجي ليس شيخا زيتونيا ولم يدرس في جامع الزيتونة، إنّما هو ينسب نفسه إلى جامع الزيتونة في حين أنّه ليس إلاّ من شيوخ الفضائيات، وله أغراض مع أشخاص أخرى لذلك يريد اقحام رجال الأمن في هذا الصراع بدعوتهم إلى اقتحام المساجد. واعتبر الشيخ الزيتوني حسين العبيدي أنّ كلام فريد الباجي مردود عليه لأنّ جامع الزيتونة يدعو الجميع إلى التراحم والتآخي، مضيفا أنّ الجامع يوجّه الناس إلى عبادة الله ورسالته التعليم وليست السياسة. وفي نفس السياق قال العبيدي إنّه لا يجوز تكفير أي شخص لأنّ كلّ التونسيين أبناءهم ويجب تعليمهم واستقطابهم وتأطيرهم شيئا فشيئا لا تكفيرهم.