أصدر حزب المؤتمر من أجل الجمهوريّة اليوم الخميس 4 جويلية 2013 بيانا أدان فيه الانقلاب العسكري على المسار الديمقراطي، معتبرا ما قامت به قيادة الجيش انتكاسة في مسار الثورة المصرية ومحاولة لإعادة تثبيت النظام القديم. وحمّل الحزب مسؤولية الانقلاب لكل النخبة السياسية المصرية الإسلامية والعلمانية في الحكم وفي المعارضة لعجزها عن ايجاد التوافقات الضرورية لعبور المرحلة الانتقالية الصعبة والعمل على تحقيق المشاركة الواسعة في تحمل أعباء الحكم. كما أدان حملة الاعتقالات الممنهجة ضد السياسيين والإعلاميين الرافضين لبيان قيادة الجيش وغلق القنوات الإعلامية والقمع الدموي ضد المحتجين على الانقلاب العسكري، مؤكدا أنّ الانقلابيين يتحمّلون المسؤولية الكاملة عن أي انفلات للأوضاع. واعتبر حزب المؤتمر من أجل الجمهورية أن ما حصل يقدم رسالة خطيرة للشعوب العربية مضمونها إحباط كل مسار انتقال ديمقراطي .